No anime/mangá Naruto existem classificações ninjas que expressam a experiência possuída por cada ninja. São divididas em categorias para que um ninja mais fraco não faça uma missão complicada. Para subir de classificação é necessário passar por um teste, que sempre é difícil e exige força, inteligência e muitos outros atributos. As classificações são as seguintes:Alunos da Academia - Todos os alunos que aprendem a ser um ninja. Ainda não podem fazer missões. Normalmente são crianças. Passam por um teste feito pelo professor do curso, um Chuunin, e só então viram Genins, divididos em grupos contendo 3 Genins e um instrutor Jounin. Se o Jounin assim quiser, ele pode fazer um teste adicional com o time que recebeu e, se considerar os alunos incapazes, pode mandá-los de volta para a academia.
Genin - Depois de passar pela Academia eles já são ninjas. Fazem missões nível D e no máximo C e geralmente não sabem técnicas avançadas. Com o tempo, seu Jounin pode achar que eles estão prontos para o Exame Chuunin, que é um teste para virar Chuunin, que é dividido em: teste escrito, teste de sobrevivência, e, se houverem muitos participantes, uma eliminatória, e finalmente um campeonato. No campeonato várias pessoas vêm do mundo inteiro para ver os ninjas, o que acaba sendo uma propaganda para os ninjas de cada vilarejo. Mesmo se a pessoa perder na primeira luta e o Hokage decidir que ele tem potencial, ele vira um Chuunin, logo, o vencedor do campeonato pode não virar um Chuunin, se ele não tiver o que é necessário.
Chuunin - Fazem missões nível C ou B, ou são levados até a Academia para virarem professores. Ainda é um mistério como se deixa de ser Chuunin e vira um Jounin.Podem fazer parte da ANBU, mas isso geralmente acontece no esquadrão médico.
Tokubetsu Jounin - Acabam sendo colocados no Ranking, entre os Chuunin e os Jounin, e executam missões selecionadas de acordo com suas especialidades. Essas missões não são limitadas à espionagem, tortura, assassinatos e outras similares, mas também se estendem à educação e pesquisa, com cada seleção de acordo com suas habilidades e conhecimento. Os ninjas desse nível também são chamados para serem os Supervisores do Exame Chuunin.
Jounin - Fazem missões B, A e S. Alguns pegam um trio de Genins para treiná-los. São a elite do vilarejo. Existem também os Jounins especiais,que exercem a função de examinadores no Exame Chuunin ou que são especialistas em treinar um certo tipo de ninja, como Ebisu, que é especialista em treinar ninjas candidatos a Hokage.
ANBU (Ansatsu Senjutsu Tokushu Butai) - Equipe especial, eles estão sob o comando direto do líder do vilarejo. Suas identidades são mantidas em segredo, e, por isso, durante as missões andam com uma máscara no rosto. Podem ser Jounins ou Chuunins. Não se mostrou como um ninja vira um ANBU. Existe ainda a ANBU Ne.
Líder do Vilarejo ou Kage - Possuem o nome de acordo com seu vilarejo (Hokage, em Konoha, Kazekage, em Suna, e assim vai). Existe somente um por vilarejo. Um ninja só pode ser nomeado para o cargo pelo conselho da vila. Administram e defendem a vila.
Nukenin - Ninjas que fogem de suas vilas por diversos motivos. Alguns vão embora por não quererem mais fazer missões, outros por que outras vilas oferecem mais poder e status(caso do Jounin Aoi) e ainda há aqueles que se juntam a organizações criminosas, como os Sete Espadachins da Névoa (Momochi Zabuza, Raiga...) e a Akatsuki(Uchiha Itachi, Sasori, Deidara...). Os ninjas da Akatsuki fazem um arranhão horizontal em suas bandanas.Oinin - Ninjas que vão atrás de Nukenins, tendo ordens de matá-los. Normalmente estudam o corpo humano para poder imobilizá-lo sem matar. Usam uma máscara para esconder a identidade. Em Konoha, quem faz esse papel é a ANBU.
Cobradores - São ninjas que vêm atrás dos pergaminhos, da Terra e do Céu, durante eventos como o Chuunin Shiken, esses ninjas roubão os pergaminhos dos Genins das provas para ganharem alguma recompensa, ou usarem em outras provas, esses ninjas são no máximo Genins com habilidades de Jounin e/ou Chuunin. Yakushi Kabuto disse que Oboro, Kagari e Mubi eram cobradores para conseguir fazer com que Uchiha Sasuke passe no Chuunin Shiken.
Ryounin - São os ninjas cozinheiros, suas missões são as de alimentar os outros Shinobis durante as missões de longo duramento, sua aparição se deu somente no episódio filler 168.
Ninja Mensageiro - São os ninjas mensageiros, eles não se importam com o conteúdo a ser entregue, e sim somente em entregá-lo. Eles não possuem nomes, são designados por seqüências numerais semelhantes aos códigos postais. Tem sua aparição somente no episódio filler 177.
Kunoichi - É a denominação dada às mulheres que são ninjas.
Divisão de Missões
D: Missões simples de serem feitas. Normalmente são cuidar de alguma lavoura, resgatar animais desaparecidos, passear com animais. Não envolvem nenhum tipo de batalha. São entregues a recentes Genins para que eles se acostumem a seus novos companheiros. São as missões mais baratas. Custo: de 5.000 à 50.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.C: Missões que envolvem sair do Vilarejo. Normalmente envolvem a proteção de alguém, a entrega de documentos oficiais. Ninjas com experiência são necessários, porém, pela baixa probabilidade do encontro de ninjas no caminho, Genins talentosos podem fazê-la, ou recentes Chuunins. Custo: de 30.000 à 100.000 ryou, o valor é de acordo com à missão.
B: São mais difíceis. Têm uma grande possibilidade de encontro com ninjas inimigos. Envolvem a proteção de coisas mais importantes e com grande risco. São entregues a Chuunins mais talentosos, ou muito raramente para Jounins. Custo: de 80.000 à 200.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.
A: A segunda missão mais difícil. Extremamente importantes, com altíssimo risco de morte. São caras, importantes, e são feitas pelos Jounins, com raras exceções, quando o Kage do vilarejo a faz. Custo: de 150.000 à 1.000.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.S: A missão mais difícil. São extremamente raras e possuem uma porcentagem altíssima de mortes. Somente os Kages dos vilarejos, a ANBU e alguns Jounins as realizam. Custo: acima de 1.000.000 ryou, o valor é de acordo com a missão.
Obs: Pode acontecer que fatos inesperados mudem o rank de uma missão no seu decorrer, como na missão do time Kakashi no país da Onda, que era para ser uma missão de ranking C e acabou virando
